デザートエンプレス（脱獄〜帰還〜エーコ誘拐後）

人質としてデザートエンプレスに残された者たちも、ジタンが帰還するのをただ待っていたわけではなかった。シドの機転によって牢獄から解放された4人は、自力でこの地を脱出するべく、宮殿の仕掛けに挑む。

攻略手順

1. 砂時計を逆さにして仕掛けを解除（シド）　操作がシドに変わる。拷問室で砂時計の仕掛けを解く。第1段階は「だるまさんがころんだ」、第2段階は「てんびんとおもり」で、ふたつを6分以内に終わらせる。間に合わなくても「もう一度やり直す」で第1段階からやり直せる。
2. 4人が合流して宮殿内へ向かう　残った4人で宮殿を探索する。操作キャラクターはエーコ、スタイナー、ビビ、フライヤの順で優先される。拷問室（脱獄後）にセーブモーグリのモジートがいてモグショップも使えるので、ここを拠点にする。
3. 仕掛けを解きながら最上部を目指す　各所の燭台に火を灯して道を開く。基本的には途中の燭台すべてに火を灯せばよいが、影の間の燭台は火を灯す順番をまちがえると先へ進めなくなる。火を灯すと紫色の光の珠「妖紅珠」が現れることがあり、調べるとアイテムが手に入るうえ、ボスの強化を防げる（下記）。
4. 宮殿の防御システムと戦う　3か所のステンドグラスを取り、最上部の燭台を調べるとヴァリア・ピラとのバトル。物理攻撃はせず、攻撃魔法を多用し、自分にリフレクをかけて跳ね返してくる。こちらもリフレク状態になれば魔法を跳ね返せる。残りMPを6以下にしても勝てるので、クイナの「マジックハンマー」も有効。バトル開始時に妖紅珠から力を得て強化されるので、先に妖紅珠の供物を取っておく。
5. 最上部から瞬間移動　ヴァリア・ピラを倒すと最上部に転移ゲートが現れ、宮殿を探索し直せる。仕掛けはすべて解除されるので、燭台の火を消したり妖紅珠からアイテムを取ったりはできない（光の間の仕掛けだけは動かせる）。パーティーにエーコがいる場合は、転移ゲートで移動する前に装備とアビリティを整えておく。エーコはこのあとしばらく仲間から離れ、次に合流するのはグルグ火山のボス戦の途中。少なくとも「毒味の術」は装備させておく。
6. ドックからクジャの部屋の前へ瞬間移動（ジタン）　ウイユヴェールから戻ったジタンたちの操作に切りかわる。全員のHPとMPが全回復し、ステータス異常も治っている。
7. クジャの部屋へ行く　エーコが離れる。主の間にネミングウェイのカードが落ちている。トレノのカードゲーム大会でマリオから取れなかった場合はここでしか手に入らないので、忘れずに拾う。
8. クジャを追って出入口へ
9. ブルーナルシスでクジャを追跡　出入口でレバーの前のフィールドアイコンを調べるとハシゴが降り、外へ出られる。出るとブルーナルシスが自動でヒルダガルデ1号を追い、閉ざされた大陸へ。
10. 閉ざされた大陸に到着

ボス

ヴァリア・ピラ

バトル開始時にデザートエンプレス内の6か所の妖紅珠から力を抽出して自身を強化する（能力値が2倍）。妖紅珠の供物を先に取っておくと強化に失敗する。「マスタードボム」「ブレイズ」は5個以上、「ホーリー」「フレア」は6個すべての妖紅珠から力を得たときだけ使う。残りMPを6以下にしても倒せる。

出現する敵

ぬすむ・おとすは確率の高い順。詳しい数値はモンスター図鑑を参照。

宝箱・入手アイテム

その他のイベント・ミニゲーム

だるまさんがころんだ

オリの中のモンスターがうしろを向いているあいだに○ボタンを連打して前進し、オリに置かれたカギを手に入れる。モンスターが振り返っているときに動くとスタートからやり直し。

てんびんとおもり

てんびんを踏み台にして砂時計のそばへ行く。シドが乗らないほうの皿に3つのおもりを載せ、シドが乗る側の皿が沈まないようにする。おもりは4つあり材質と重さが違う。正解は「土→石→鉄」の順。載せ終わるまでに30秒ほどかかるので、よく考えてから。

妖紅珠の秘密

特定の燭台に火を灯すと妖紅珠が現れる。妖紅珠は6つあり、調べるとそれぞれに供えられたアイテムが手に入る。妖紅珠はヴァリア・ピラを強化する役目があり、アイテムを取ると妖紅珠は消えて強化されなくなる。バトル開始までに調べなかった妖紅珠はバトル終了後に消える。5個以上残っていると「マスタードボム」「ブレイズ」、6個すべて残っていると「ホーリー」「メテオ」が追加される。

燭台に火を灯して宝箱出現

燭台と扉・石像の変化の対応は、各マップの仕掛けに従う。

取り返しのつかない要素